Desa Pamalian Kecamatan Kota Besi merupakan desa yang berada di daerah Dataran Rendah, dengan ketinggian ±  30 Meter Diatas Permukaan Laut (DPL).  Desa Pamalian Kecamatan Kota Besi memiliki luas yang sudah disepakati dengan desa yang berbatasan sebesar ± 4.900 Ha, dan lahan desa selain digunakan sebagai tempat pemukiman dan perkantoran sebagian besar digunakan sebagai lahan pertanian dan perkebunan oleh masyarakat setempat.

Secara geografis Desa Pamalian berada pada titik koordinat 2° 15.523'S, 112° 51.482'E dan secara administratif merupakan salah satu dari 9 (Sembilan) desa yang berada di Kecamatan Kota Besi Kabupaten Kotawaringin Timur.